太湖湖底的构成是复杂的。太湖湖底基本上为坚硬的黄土层所组成，其上覆盖着现代淤泥，厚度从几厘米到20厘米不等。湖底地形十分平坦，大部分地形的水深在1.5~2.5米之间。然而，受泥沙淤积和围湖造田等因素的影响，太湖的面积和水位都有所变化。湖底的石灰岩在长期受到波浪的冲击和含有二氧化碳水的溶蚀作用下，形成了太湖石，这些太湖石在唐代已有开采，后世也继续开采。

因此，可以说太湖湖底并非全由石头构成，而是由黄土层、淤泥以及部分石灰岩组成。在某些地方，特别是受到波浪冲击和溶蚀作用的地方，可能存在裸露的石灰岩，即太湖石。所以，太湖湖底并非完全是石头，而是多种物质共同构成的复杂地质环境。