不能申请低保，低保与家庭收入有关。

孩子先天性心脏病可以申请医疗保险，但低保的话和这个关系不太大和你家庭的收入相关。如果你年收入上百万即使有先心病你也不属于低保户。如果因为治疗孩子的病使家庭经济陷入困难他们应该会考虑这方面的因素。