回答如下：中天公司的总部建在海门，而不是启东，可能是由于以下原因：

1. 地理位置：海门位于江苏省南通市的东南部，毗邻上海，交通便捷，有高速公路和铁路贯穿。而启东则位于南通市的北部，距离上海较远，交通不便。

2. 城市规划：海门是一个经济发展比较快的城市，有完善的城市规划和基础设施，可以为中天公司的发展提供更好的支持。

3. 人才资源：海门拥有丰富的人才资源，这对于中天公司的发展非常重要。海门还有多所高等院校和科研机构，可以为中天公司提供更多的技术和人才支持。

综上所述，中天公司选择在海门建立总部，可能是因为海门具有更好的地理位置、城市规划和人才资源。