根据杭州落户政策，毕业生在杭州落户需要提供毕业证书等相关证明文件。因此，如果毕业证丢失，可能会影响落户申请。建议您可以先咨询杭州市相关部门或者派出所户籍处，了解补办毕业证或者出具相关证明的具体流程和要求。同时，在落户申请时，也可以咨询相关部门是否可以提供其他相关证明材料来代替毕业证书。