对于是否能在4℃的温度下运输已经提取好的蛋白进行WB分析，需要具体根据蛋白的稳定性和运输时间的长短来考虑。

一般来说，如果运输时间较短，且蛋白已经稳定，那么在4℃下运输是可以的。然而，如果运输时间较长，或者蛋白容易降解，那么在4℃下运输可能会影响蛋白的稳定性。

因此，为了确保蛋白的稳定性，建议您在运输前咨询相关专家或查看相关的实验指南，以确定最佳的运输条件。