AJ蜘蛛侠GS40码与男版40码的主要区别在于鞋子的配置、内长和宽度。GS是“大男孩”的意思，其配置通常较低，适合儿童或脚型较窄的人穿着。而男版40码则配置较高，适合成年男性或脚型较宽的人穿着。此外，GS40码的内长通常比男版40码要短一些，宽度也可能更窄。因此，在选择时，建议根据个人脚型和实际需求进行选择。