淘宝店铺在1688发货不算违规，但需要遵守相关规定。根据淘宝规定，卖家可以同时在多个网站售卖商品，包括1688，但必须遵守规定，并确保在淘宝平台上交易记录的真实性。此外，卖家应当遵守物流相关政策，确保所发货物符合相关要求，避免出现违规现象。总之，淘宝店铺在1688发货需要遵守相关规定，符合规范才能获得顾客认可和信赖。