上海崇明岛的部分地区不实行住宅限购政策，可能是由于以下原因：

- **行政区划**：崇明岛的绝大部分区域属于上海市，但有一小部分区域属于江苏省启东市和海门市。例如，崇明岛上的启隆镇和海永镇，这些区域在行政上隶属于江苏省，因此不受上海市的限购政策影响。

- **发展规划**：根据《上海崇明2035发展规划》，崇明岛将被打造成世界生态岛，而且岛上的南通“飞地”已经划入了上海崇明的发展范围，享受同等的发展红利。这表明上海市政府对于崇明岛的发展给予了高度重视，未来的发展潜力巨大。

综上所述，上海崇明岛不限购的原因主要与其特殊的地理位置和行政区划有关。同时，崇明岛的未来发展规划也显示出其重要的战略地位和潜力。