当妹妹说她很挂念你时，你可以回复她以表达你的感激和回应她的情感。以下是一些可能的回复方式：

感谢你的挂念，我也很想你。我们找个时间好好聚聚吧！

听到你这么说，我很开心。我也一直在想念我们在一起的时光。

谢谢你的关心，我也一直惦记着你。希望我们能尽快见面，好好聊聊。

无论选择哪种回复方式，都要表达出你对她的感激和回应，让她感受到你的情感共鸣和关心。同时，也可以根据实际情况和两人的关系来决定回复的亲密程度和语气。重要的是，要保持真诚和温暖的态度，让妹妹感受到你的情感支持和联系。