一、物理方法
物理方法主要包括过滤吸附法、曝气充氧法、泡沫分离法和紫外线照射法等。
扇贝养殖废水中存在大量悬浮颗粒物，过滤吸附法是最经济快捷的方法，机械过滤主要用于直径为60～200 μm的悬浮颗粒物处理。
泡沫分离法有独特的优势，能将悬浮颗粒物通过气泡的浮力和表面张力形成泡沫从而达到去除的目的。
二、化学方法
化学方法主要包括絮凝沉降法、臭氧消毒法、电化学法等。
絮凝沉降法常用于去除水体中的悬浮颗粒物。自然水体中胶体粒子大多带负电荷，加入铁盐、铝盐、聚丙烯酰胺、氢氧化钙等带正电荷的絮凝剂可以使胶体粒子聚集形成絮团下沉，从而达到去除悬浮颗粒物的目的。