PCR探针法和染料法是两种常用的基因检测方法，它们在原理和应用方面有一些区别。
PCR探针法是一种通过PCR技术检测特定DNA序列的方法。它使用两个引物，在PCR反应中扩增目标DNA序列，同时还加入一种探针。这种探针通常标记有荧光染料，当PCR反应中的目标DNA序列与探针完全匹配时，探针被酶切产生荧光信号，可以通过荧光检测仪器进行定量检测。
染料法是一种通过染色剂检测DNA或RNA的方法。它通常使用荧光染料或比色剂对DNA或RNA进行染色，通过观察染色结果来判断有无目标序列。染料法不需要进行PCR扩增，因此可以直接检测样品中的DNA或RNA。
在应用方面，PCR探针法常用于定量检测特定DNA序列的含量，例如在基因表达研究中，可以通过PCR探针法检测目标基因的表达水平。染料法通常用于检测DNA或RNA的存在与否，例如在分子生物学实验中，可以通过染料法检测PCR产物的纯度或分离和鉴定DNA或RNA条带。