如果新农合医疗本丢失，一般情况下是不能办理住院报销的。但是，如果参保人因病不能亲自办理，可以委托他人携带本人及参保人的有效证件到医保中心申请补办，或者到服务点申请代为办理，一般3个工作日就可以办结。在办理住院手续时，参保者只需凭借个人身份证即可报销。