雅马哈R3欧版排气是否可以备案，需要看当地交通管理部门的具体规定。一般来说，如果排气改装符合当地的相关规定，那么是可以进行备案的。

在改装排气之前，建议先了解当地的相关法规和规定，确保改装符合要求，以免造成不必要的麻烦。同时，为了确保车辆的安全和合法性，建议在正规的改装店进行改装，并按照相关规定进行备案。