产权证书办理程序为：

向房屋所在地房地产登记部门提交申请材料和申请登记调查；

当地房地产登记机构受理，初审后报市房地产登记中心审核；

市房地产登记中心批准并在登记簿上记录登记事项；

申请人应在房地产登记窗口支付并领取产权证书。