小南瓜栽培品种甚多，根据植物学家对世界上的南瓜归类有以下五种：西洋小南瓜( C. maxima )、中国小南瓜( Cucurbita moschata )、美国小南瓜( C. pepo )、黑子小南瓜(C. ficifolia)、墨西哥小南瓜(C. mixta)。