安徽中医药高等专科学校和安庆医药高等专科学校都是位于安徽省的医学类高等专科学校，两所学校各有特色。

安徽中医药高等专科学校：该校是一所以中医药为主，中西医结合、多学科协调发展的全日制普通高等专科学校。学校设有中医、针灸推拿、中药学、护理、医学影像技术等专业，其中，中医药类专业是其强项。

安庆医药高等专科学校：该校是一所以医药卫生类专业为主的全日制普通高等专科学校，设有护理、临床医学、药学、医学检验技术等专业。

两所学校各有优势，选择哪所学校主要取决于你的兴趣和职业规划。如果你对中医药有浓厚兴趣，那么安徽中医药高等专科学校可能是更好的选择；如果你对西医或医药卫生类专业更感兴趣，那么安庆医药高等专科学校可能更适合你。