如果卫生间的管道位于楼下的房顶上，需要进行管道改造以满足新的设计需求，可以按照以下步骤进行：

1. 规划设计：确定新的卫生间布局和管道走向，并制定改造计划。

2. 找出管道走向：在楼下的房顶上找出当前的卫生间管道走向，了解其具体位置和连接情况。

3. 开始施工：根据新的设计规划，将需要改造的管道段进行拆除，注意防止破坏其他管道或结构。

4. 调整管道走向：根据新的设计，调整卫生间管道的走向。这可能涉及重新安装新的水平或垂直管道，可能需要穿过墙壁或地板。

5. 连接管道：使用管道连接件和密封材料将新的管道与现有管道连接起来，确保连接牢固和密封。

6. 进行测试：在完成管道改造后，进行水压测试和漏水测试，确保管道系统正常工作且没有泄漏。

7. 完工：当所有改造工作都完成后，进行清理和整理，确保管道系统的外观整洁，并恢复原来的房顶状况。

请注意，在进行卫生间管道改造时，建议咨询专业的管道工程师或装修工程师，以确保改造过程安全可靠，并符合当地建筑规范和技术要求。