生鲜部门存在的问题可能包括：

温度控制不当：生鲜食品对温度和湿度的要求比较高，如果存储温度过低或过高，会影响到产品质量，减短保质期。同时，员工未能及时发现变质食品也会导致生鲜品质下降。

库存管理不足：生鲜食品保质期较短，需要加强库存管理，确保商品新鲜、品质优良，并且根据库存情况制定科学的补货计划，避免出现大量压货或缺货等情况。

分类组织不清：生鲜食品有时候需要按照季节或特定消费群体需求进行分类组织，以便对不同客户提供更好的服务。如果组织混乱，往往会引起顾客投诉和销售下降。

改善建议可包括以下几点：

优化仓库管理：建立严格的货物分类体系和温度监测系统，规范货品入库流程，对于过期、破损或者有异味的商品及时处理或下架。优化仓库库区规划，合理利用仓库空间、提升货品重量承受能力等，实现科学管理。

强化员工技能培训：加强员工鲜食食品的相关检查和认知，确保生鲜食品的新鲜度和把关质量。同时建立完善到货、发货和盘点制度，减少因人为原因造成的误差。

加强顾客服务意识：加强顾客需求的了解和反馈体系，并提供一些方便的服务，例如蔬菜加工、肉类切割等服务，满足顾客个性化需求。

加快冷链物流建设：运输链路上采取冷藏运输措施，优化各生产加工环节，以保持产品的新鲜度和品质。

综上所述，通过科学的管理方法、加强顾客服务、提高物流效率等方式修补生鲜部门存在的问题，可以达到更好地满足市场需求，提升企业竞争力并取得更好的经济效益。