南京公积金在线还款是指使用公积金账户余额进行贷款的在线还款操作。具体来说，您可以通过南京公积金的官方渠道（如“南京公积金”APP）进行实名认证后，选择“在线还公积金贷款”功能，并根据您的需求选择“部分还款”或“结清还款”等选项。在线还款不受额度限制，且实时生效。这种还款方式方便快捷，无需到线下银行网点办理，为公积金贷款用户提供了更加灵活和高效的还款方式。

请注意，如果您已经签订了每月还款协议，进行提前还款时，您的账户余额中必须留有足够的存款金额（通常为13个月的存款金额），否则每月还款协议可能会受到影响。因此，在进行在线还款操作前，请确保您已经了解并遵守了相关的规定和要求。

另外，南京公积金中心已经实现了全程网办，您可以随时随地通过手机或电脑进行在线还款操作，极大地提高了办理效率和便捷性。如果您在操作过程中遇到任何问题或疑问，可以随时联系南京公积金中心的客服人员进行咨询和解答。