工伤后遗症由用人单位或工伤保险基金开证明。具体由谁开证明，要根据具体情况而定：

如果是因为工作原因导致受伤，可以向用人单位提出工伤认定申请，并由用人单位出具工伤认定申请表。

如果是因为其他原因导致受伤，可以向工伤保险基金提出工伤认定申请，并由工伤保险基金出具工伤认定申请表。

需要注意的是，无论是由用人单位还是由工伤保险基金出具工伤认定申请表，都需要提供相关的证明材料，包括但不限于医疗诊断证明、职业病诊断证明书、身份证等。同时，如果需要进一步确认工伤后遗症的情况，可以向医疗机构或者劳动能力鉴定机构咨询。