房顶有裂缝漏水的最好方法是：

1. 清理与准备:首先清理地面和房顶，将附着在屋顶上的杂物、水泥、灰尘和老油漆刮掉。如果有摩天水，必须清理掉。然后，检查房顶是否有裂缝，能否找到漏水的位置。根据漏水的位置，选择相应的修复方法。选用适合的密封胶，涂在漏水处的裂缝上。

2. 补漏:为了使密封效果更好，建议在涂抹密封胶前，用沙纸对裂缝周围的部分进行打磨或抛光，以方便胶水涂抹均匀。然后，使用刮板或刷子将密封胶均匀涂抹于裂缝处，并使之贴紧裂缝表面。

3. 收尾: 等待密封胶干燥后，再进行后续的修补工作，如粉刷和涂漆等。

需要注意的是，涂抹密封剂的时候要保证天气晴朗，避免在高温或下雨天施工。如果漏水较严重或不确定如何处理，建议查找专业机构或水电工寻求帮助。