区别是两者建筑风格完全不一样，闽南大厝以官式大屋为主，故又称宫起。在许多地区，它也被称为红砖屋。它看起来像一座宫殿，宏伟壮丽，是中国古代民居的典型例子。其主要特点是前后屋，朝南，三五开间加双护屋，红砖白石墙，硬山屋顶，双翘燕尾脊。

而别墅一般是独栋别墅即独门独院，上有独立空间，下有私家花园领地，是私密性很强的独立式住宅，表现为上下左右前后都属于独立空间，一般房屋周围都有面积不等的绿地、院落。