门诊检查费个人自费后可以通过两种方式进行报销，一种是自费部分可以用医保报销，需要将收据、报销申请表等相关材料提交给医保中心进行申请；另一种是可以用商业保险进行报销，需要将收据、保险公司要求的材料进行提交即可。不过，具体报销流程和报销额度视医保政策和商业保险规定而定，需根据实际情况进行咨询和操作。