小马宝莉端盒剩下的盒子可以进行再利用，比如可以用来储存小物件，如文具、首饰、纽扣等，也可以用来制作手工艺品，如卡片、相框、玩具等。

此外，还可以将盒子剪裁成各种形状，用来做各种DIY手工，如贴画、剪纸等。

如果有创意，还可以将盒子进行涂饰、贴纸等装饰，制作成独特的礼品盒或收纳盒。总之，小马宝莉端盒剩下的盒子可以发挥无限的想象力，创造出各种有趣的用途。