王牌专业：环境工程技术、环境监测技术、植物保护与检疫技术、园艺技术等。

南通科技职业学院始建于1945年，经历过国立高级农业职业学校、南通农业专科学校、江苏省南通农业学校等时期，所以农业及相关专业是其优势专业。