甘南清水沟位于中国甘肃省甘南藏族自治州迭部县境内，是一个风景优美的自然景区。以下是从甘南市区到清水沟的大致路线：

1. 从甘南市区乘坐长途客车或者租车前往迭部县。

2. 在迭部县城，可以选择继续乘坐公共交通工具（如出租车、面包车等）或者自驾前往清水沟。

3. 一般情况下，您需要先到达迭部县狄道镇（距离迭部县城约15公里），然后在狄道镇找当地向导或者咨询当地居民，获得更详细的路线指引。

4. 根据当地指引前往清水沟景区。

请注意，由于道路和交通条件可能有所变化，请提前做好详细的旅行计划和调查，并咨询当地人士以获取最新的路线信息。