要在福建省网上办事大厅注册分公司，首先需要登录网上办事大厅官网，进入注册页面填写相关信息，包括公司名称、注册资金、法定代表人等，并上传相关资料，如身份证明、企业营业执照等。

然后进行在线支付注册费用，等待审批结果。如审批通过，将收到相关文件和证照。

最后，到当地工商行政管理部门办理相关手续，领取营业执照并完成分公司注册。