温州灵活就业人员可以通过以下三种方式缴纳住房公积金：

1. 委托银行对私划扣：灵活就业缴存者应先签署《委托银行收款协议书》（三方协议），委托银行将根据协议按月在15日至20日内从缴存者个人银行账户上划扣资金缴存。

2. 在市公积金中心柜台送缴：灵活就业缴存者可在管理机构柜台一次性送缴半年或一年的缴存额（银行卡刷卡）。

3. 第三方支付平台自助缴存。

更多详细步骤可以到温州住房公积金管理中心官网查询。