《天空之城》背后传达了对自然环境和生态平衡的关注。影片中展现了一个美丽而宁静的天空之城，与之相对的是地面上被人类活动破坏的环境。这里的深意在于展示了人类与自然之间的矛盾与不和谐。同时，这也是对人类贪婪、独占和无节制开发自然资源的批判。

通过呈现废弃的旧工业场所和污染的城市，电影试图唤醒观众对于环境保护的重视，并反映出人类需要与自然和谐共存的意识。