首先，两者的学习方式不同。自考专业通常更加灵活，适合那些无法参加全日制学习的学生，如在职人员或有其他特殊需求的学生。他们可以通过自主学习、在线课程等方式完成学业。而本科则通常需要学生参加全日制学习，按照学校的课程安排和教学进度进行学习。
其次，两者的考试和毕业要求也有所不同。自考专业的考试一般由省考试院出题并评定成绩，而本科的考试则由学校出题并评定成绩。此外，自考专业的毕业要求通常包括完成规定的课程学习并通过考试，而本科则可能需要完成毕业论文、实习等更为复杂的毕业要求。
总的来说，华南理工大学的自考专业和本科各有其特点和优势，选择哪种方式取决于个人的学习需求和能力。无论选择哪种方式，都需要付出努力和时间来完成学业。