注册了医师助理证的助理医师在法律上已经开始了执业活动，因此不再算作毕业生择业期。
详细来说，毕业生择业期是指学生在完成学业，取得毕业资格后，的一段时间内，学校允许学生暂缓就业，在就业前进行自主选择职业的时间段。在这个期间，学生仍享受学校的就业指导和服务，可以自由更换就业意向、选择就业单位。而注册了医师助理证意味着助理医师已经开始了实际的执业活动，他们需要按照相关法律法规进行注册、领取执业证书，开始在医疗机构中进行专业医疗服务。因此，从法律上讲，注册了医师助理证的助理医师已经开始了实际的执业活动，已经不在校方的毕业生择业期范围内。