在T3记账凭证中，设置往来客户的方法是先进入“财务”模块，在“客户管理”中添加该客户的相关信息，之后在记账凭证中选择“借方”或“贷方”对应的科目，然后在“摘要”栏中填写往来客户的名称或编号，在“对方科目”栏中选择对应的往来客户科目，最后填写金额即可完成记账凭证的设置。

这样就可以在日后的财务处理中通过往来客户的名称或编号方便地进行查询和核对。