在用友T3项目中，客户编号可以通过以下步骤进行修改：

首先，进入系统管理菜单，找到客户资料维护选项，点击进入。

然后，在客户资料维护界面中，找到要修改的客户编号，点击编辑按钮。

在编辑界面中，将原有的客户编号替换为新的客户编号，保存修改即可。需要注意的是，修改客户编号可能会影响到系统中与该客户相关的数据，如订单、发票等，所以在修改之前需要谨慎考虑。