告个体户和告公司的主要区别在于被告的主体不同。个体户是以个人为单位从事经营活动的，而公司则是以企业为主体进行经营活动的。

在法律上，个体户和公司都是可以成为被告的。但是，由于两者的经营方式、组织结构等方面存在差异，因此在诉讼中可能会有不同的处理方式。例如，对于个体户来说，其经营者可能需要承担更大的责任；而对于公司来说，则可能存在多个股东或部门之间的责任划分问题。