耐根穿刺SBS防水卷材和耐根穿刺高分子防水卷材都有其各自的优劣。耐根穿刺SBS防水卷材具有良好的耐腐蚀、耐老化性能，能够抵御根系穿刺和液体渗透，具有良好的防水效果，但价格相对较高；而耐根穿刺高分子防水卷材自重轻、施工方便，且成本低，但相对防水效果较弱，对于细小的根系穿刺的阻碍效果不如SBS防水卷材。因此，在具体使用场景中需要根据不同情况进行选择。