拼多多平台对于商家的处罚，是基于其平台的规章制度和合作协议来进行的。当商家违反相关规定时，例如刷单套券等行为，拼多多平台会采取相应的处罚措施。

对于被罚款五万元保证金的商家，如果选择不缴纳保证金并退店，可能会面临其他影响，如货款被扣、欠款累积等。但这并不意味着平台会“乱处罚”。所有的处罚都是基于商家的违规行为，并且平台会在处罚前发出通知，给予商家改正的机会。因此，商家应该遵守平台规定，确保经营合规，避免不必要的损失。