动物近亲繁殖可能会存在一定的遗传问题，主要是因为二倍单倍体的基因重组不完全，导致有些基因表现隐性，或者打破了自然选择的平衡，从而导致后代有机会受到一些有害遗传突变的影响。但是，理论上这种问题并不是近亲繁殖必然会出现的，而是高于正常杂交繁殖的风险。实际上，在某些动物类群中，近亲繁殖是常见的自然繁殖模式，如一些蜥蜴、鱼类、鸟类和哺乳动物，这些动物在进化过程中逐渐适应了近亲繁殖对遗传多样性的影响。

在自然环境中，当动物群体数量较小时，由于机会的限制，使得近亲繁殖相对普遍。此时，一些隐性突变等影响遗传多样性的因素可能被平衡，并不一定会导致遗传缺陷的传递。

另外，自然选择还能够让不利遗传变异被淘汰，进一步减少了遗传问题的风险。然而，在群体数量和基因库不足时，近亲繁殖仍然可能导致较高的基因缺陷率，因此，有多么严重的影响仍然需要具体情况具体分析。