酸奶过滤器发霉会影响酸奶的质量和卫生安全，需要及时清洗。清洗后如果发霉的部分没有被完全清除，还可以使用，但要注意定期检查是否有细菌或霉菌滋生，避免对健康造成伤害。如果清洗无效或故障，最好及时更换新的酸奶过滤器维护食品卫生。为了健康饮食，建议每隔一段时间更换过滤器。