不会影响。

因为: 1、工商年检的主要目的是审核已登记的公司是否合法经营,是否具有继续经营的能力。 2、工商年检的主要内容是 (1)企业登记事项执行和变动情况。(2)股东或者出资人的出资或提供合作条件的情况。(3)企业对外投资情况。(4)企业设立分支机构情况。(5)企业生产经营情况。 所以,去年的利润总额是负数,不会影响你单位的年检。