江苏耕耘化学有限公司和江苏耘农化工有限公司是两家不同的公司，它们的注册地、注册资本、经营范围等方面都不同。

江苏耕耘化学有限公司是位于江苏省泰州市海陵区的一家化工生产企业，主要从事化学品的生产和销售。经营范围包括有机化学品、无机化学品、颜料、热塑性弹性体等。

江苏耘农化工有限公司是位于江苏省徐州市邳州市的一家化工企业，主要从事生产、销售各种化肥、氨水、硫酸铵等产品。经营范围包括化肥、农药、种子、微量元素肥料等。