住院期间门诊自费是否影响住院报销，主要取决于具体的医保政策。

一般来说，住院费用和门诊费用是分开报销的。住院期间发生的门诊费用不会直接影响住院费用的报销申请。对于一些急诊急性病情况，在住院期间发生的门诊医疗费用可以纳入住院费用的报销范围。

因此，如果是在住院期间发生的门诊自费费用，希望进行报销，要携带相关材料，如本人身份证、医保卡、医院急诊病历等，按照当地医保部门的规定进行报销。具体操作可以咨询当地医保部门或相关部门，以获得最准确的信息。