目前，大理机场稳定运行的航线直飞的有大理至上海（虹桥）、长沙、成都、广州、合肥、绵阳、武汉、西安、南京、郑州、重庆、贵阳、昆明、西双版纳、泸州等。近期将逐步恢复或新开至北京（首都）、北京（大兴）、上海（浦东）、南宁、南昌、拉萨、福州等航线，以及大理至昆明的晚班航班。