净水器三管水龙头的原理是通过一条管道输送自来水，另外两条管道分别输送净水和废水。首先，自来水通入净水器，经过预处理器，如网过滤器、固定负离子，过滤掉大颗粒杂质和有机物，然后进入RO反渗透膜组件。

RO反渗透膜通过高压下让水分子从盐分分子中挤出，实现将自来水变成净水。废水随之产生，被分别从另外一根管道排出。最终，用户可以通过三管水龙头选择需要的水源，实现健康饮用水的获取。