箱龟摇头的原因可能有以下几点：

1. 行为表达：箱龟摇头可能是一种行为表达，用来表示它们的情绪、需求或者对周围环境的反应。例如，当箱龟感到兴奋、好奇或者紧张时，它们可能会摇头。

2. 清除视线：箱龟摇头可能是为了清除眼前的视线，比如当它们的眼睛被水或者其他物体弄湿时，它们会摇头来清除眼睛上的水珠或者其他物体。

3. 耳朵清理：箱龟的耳朵位于头部两侧，有时候它们可能会摇头来清理耳朵里的异物或者耳垢。

4. 舒缓痒感：箱龟可能会因为头部瘙痒而摇头，这是一种自我舒缓的行为。

5. 疾病或寄生虫感染：如果箱龟频繁摇头，可能是因为它们患有疾病或者寄生虫感染。这时候需要观察箱龟的其他症状，并及时就诊。

总之，箱龟摇头的原因有很多，需要根据具体情况来判断。如果箱龟频繁摇头且伴有其他异常症状，建议及时就诊。