巴氏杀菌主要分为以下几种类型：
高温短时巴氏杀菌：此方法在72°C~75°C的温度下，持续15~30秒进行杀菌。这种方式能够消除大多数的细菌和病毒，包括大肠杆菌、沙门氏菌、李斯特菌等致病菌，但可能对一些耐热的细菌效果不佳。由于加热时间较短，产品的口感和营养成分能够得到较好的保留，但保质期相对较短。
低温长时巴氏杀菌：这是一种在较低的温度下，通过更长时间的加热来进行杀菌的方法。它主要用于杀死细菌，对病毒的效果可能较差。这种方法能够保持产品的营养成分和口感，但杀菌效果可能不如高温短时巴氏杀菌。
超高温瞬时杀菌：这种方法通常用于咖啡奶酪和盒装果汁的杀菌处理。产品被加热到超过沸点的温度（通常在压力状态下达到250°C），并在极短的时间内进行瞬时杀菌。通过这种方式，产品可以达到无菌状态，从而不需要冷藏。然而，这种高温处理可能会导致产品出现煮熟的味道，并且可能会损失一些重要的营养成分，如维生素和氨基酸。
需要注意的是，巴氏杀菌并不能完全消除所有的细菌和病毒，而且食品在消毒后还可能受到二次污染。因此，即使经过巴氏杀菌处理，食品仍需要在适当的条件下保存，以确保其安全性和品质。