可以。农村合疗门诊可以刷医保卡，这是因为农村合疗是一种医疗保险制度，与城镇职工医保类似，可以享受医保政策的待遇。在农村合疗门诊就诊时，患者可以使用自己的医保卡进行刷卡结算，享受医保报销的待遇。需要注意的是，不同地区的农村合疗政策可能有所不同，具体情况需要根据当地的政策来确定。