如果在河南交的医保在江苏南通医院报销时查不到参保信息，可能有以下几种原因：

1. 医保系统故障：可能是由于医保系统故障导致无法正常查询参保信息。

2. 信息同步问题：由于医保系统信息同步存在问题，导致查询不到参保信息。

3. 数据库错误：可能是由于数据库错误导致无法查询到参保信息。

4. 其他原因：可能还存在其他未知原因导致无法查询到参保信息。

对于这种情况，建议联系当地的医保机构或者南通医院的医保部门，向他们咨询具体的解决办法。同时，也可以向当地的社保部门咨询，了解是否存在其他未知问题导致无法查询到参保信息。